Resumen
La eficiencia alimentaria es clave en la producción porcina, ya que influye tanto en la rentabilidad como en la sostenibilidad de las granjas porcinas. Esta tesis explora estrategias para mejorar la eficiencia alimentaria en cerdos, centrándose en caracteres de comportamiento, efectos sociales y la composición microbioma. Utilizando datos de cerdos Pietrain e Ibéricos criados en condiciones intensivas, el trabajo integra información de consumo obtenida a través de comederos automáticos y la composición microbiana fecal para investigar nuevos enfoques que permitan mejorar la eficiencia alimentaria.
En primer lugar, se evaluaron los parámetros genéticos de comportamiento y de eficiencia alimentaria en una población Pietrain durante el período completo de testaje, así como en dos subperíodos. A partir de estos parámetros genéticos, se analizó la incorporación de caracteres de comportamiento alimentario en los índices de selección genética. Los caracteres de comportamiento alimentario mostraron heredabilidades de moderadas a altas, siendo estas consistentes entre el primer período y el total. Sin embargo, los caracteres de eficiencia alimentaria medidos en períodos más cortos mostraron una menor heredabilidad en comparación con los evaluados durante todo el período de testaje, lo que indica que este grupo es sensible al número de registros. Los caracteres de comportamiento alimentario, especialmente el número de visitas por día y la velocidad de alimentación, se correlacionaron con la eficiencia alimentaria. Su incorporación en los índices de selección mejoró tanto la precisión como la respuesta a la selección, en particular para la ganancia residual, con mejoras de hasta un 19%.
En segundo lugar, se aplicó un modelo basado en visitas para evaluar los efectos genéticos sociales sobre el comportamiento alimentario y la ingesta. Esta evaluación se llevó a cabo por separado para las poblaciones de cerdos Pietrain e Ibéricos. Mientras que en la raza Pietrain los efectos genéticos sociales fueron mínimos, en los cerdos Ibéricos representaron una proporción significativa de la varianza fenotípica, lo que sugiere un potencial para estrategias de selección dirigidas a mejorar la productividad grupal. Además, se observó una correlación nula entre los efectos genéticos aditivos directos y los efectos genéticos sociales, lo que sugiere que ambos efectos podrían ser seleccionados de forma independiente.
En tercer lugar, se exploró la contribución del microbioma intestinal muestreado a los 140 y 180 días de edad en caracteres de eficiencia y comportamiento alimentario, así como el uso potencial del microbioma a los 140 días como predictor temprano de los fenotipos a los 180 días. La composición microbiana explicó una proporción moderada de la variación fenotípica en ambos grupos de caracteres, con estimaciones muy similares entre los dos puntos de muestreo. Se aplicaron distintos modelos que incluían la genética, la composición microbiana o ambos efectos combinados.
Por último, se utilizaron modelos recursivos para separar los efectos genéticos directos de los efectos mediados a través de la microbiota intestinal. Estos modelos permitieron obtener los parámetros causales para cada taxón microbiano, así como su heredabilidad. Con base en estos parámetros, fue posible identificar géneros microbianos con efectos causales sobre el índice de conversión alimentaria y el consumo residual.
En conjunto, las nuevas fuentes de información exploradas en esta tesis, el comportamiento alimentario, los efectos genéticos sociales y la composición microbiana intestinal, representan oportunidades para perfeccionar las evaluaciones genéticas y mejorar la eficiencia alimentaria en cerdos. Los resultados destacan el potencial de estos caracteres emergentes en los programas de selección porcina.