DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA LA RACIONALIZACION DE COLECCIONES DE GERMOPLASMA: APLICACION A COLECCIONES DE TOMATE DE LOS BANCOS ESPAÑOLES

2017

INST. NAC. DE INVESTIGACION Y TECNOL. AGRARIA Y ALIMENTARIA -INIA

INV. COMPETITIVA PROYECTOS

Díez Niclós María José

Los bancos de germoplasma son un repositorio fundamental de los recursos fitogenéticos estratégicos para el futuro. El valor de estos recursos depende fundamentalmente de la disponibilidad de los mismos y de los datos asociados a ellos. En los bancos se mantiene una gran cantidad de valiosa información asociada a las entradas conservadas, generada a lo largo del tiempo, en el marco de distintos proyectos. Sin embargo, la realidad es que estos datos no están accesibles para los usuarios en la mayoría de las colecciones, lo cual condiciona seriamente su utilización .. Es el caso de las colecciones de germoplasma españolas de especies hortícolas .. El presente proyecto trata de contribuir a la resolución de esta situación, empezando por localizar, organizar y armonizar la información existente y hacerla disponible a los usuarios .. El objetivo global es la construcción de una herramienta informática que permita la introducción, actualización y manejo eficaz de datos de pasaporte, caracterización e imágenes de los recursos fitogenéticos de tomate conservados en España, así como el uso de esta herramienta para introducir y hacer accesibles los datos pertinentes. Aunque en este proyecto se trabajará con los datos de tomate, esta herramienta será diseñada para que pueda ser utilizada en cualquier cultivo .. Los objetivos parciales son: 1 - Construcción de la herramienta informática 2 .. - Comprobación de la herramienta y corrección de errores y deficiencias 3 .. - Introducción de datos de pasaporte, caracterización e imágenes de las colecciones de tomate españolas en la herramienta 4 .. - Análisis de los datos disponibles para buscar redundancias entre colecciones y generar un informe de los recursos fitogenéticos de tomate disponibles en España 5 .. - Caso-estudio combinando datos de genotipado y de pasaporte y caracterización para la identificación de duplicados en un grupo de 320 entradas de tomate del banco de germoplasma del COMAV La construcción de la herramienta será realizada por un técnico informático, que en todo momento estará en contacto con los conservadores de las colecciones de tomate españolas, con el fin de plasmar en la herramienta las necesidades de los conservadores y usuarios para el manejo de las colecciones y para la optimización de su utilización .. Una vez construida la herramienta se realizarán unas Jornadas para explicar el funcionamiento de la misma a los bancos de germoplasma y colecciones .. A continuación se introducirán todos los datos de pasaporte, caracterización y las imágenes de las que se disponga en los bancos .. El análisis de toda esta información permitirá conocer en profundidad nuestras colecciones, identificar duplicados, establecer colecciones representativas de la diversidad total (colecciones nucleares) y plantear futuros proyectos con mayor conocimiento del material de tomate disponible en España