IDENTIFICACION DE GENES ASOCIADOS A ESTRESES BIOTICOS Y ABIOTICOS MEDIANTE EL USO DE UNA POBLACION MAGIC (SOLANUM PIMPINELLIFOLIUM Y SOLANUM LYCOPERSICUM VAR CERASIFORME)

2021

AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACION

INV. COMPETITIVA PROYECTOS

Vilanova Navarro Santiago

El tomate (Solanum lycopersicum L.) es la hortaliza líder a nivel mundial. Sin embargo los procesos de domesticación de este cultivo llevaron al estrechamiento de su base genética y, consecuentemente, a su vulnerabilidad frente a estreses bióticos y abióticos. Por ello, las especies silvestres han jugado un papel esencial en la mejora genética de este cultivo. Las especies más distantes presentan severas barreras de incompatibilidad con el tomate. Aunque ésta se ha conseguido superar mediante diversas técnicas biotecnológicas, resulta más sencillo y rápido explotar los caracteres de interés de las especies más cercanas. Solanum pimpinellifolium y Solanum lycopersicum var cerasiforme, son la especie silvestre más próxima y el ancestro del tomate, respectivamente. Por este motivo resulta especialmente interesante su explotación en mejora. S. pimpinellifolium ha sido empleada en mejora por su resistencia a diversos patógenos, principalmente hongos y bacterias. S.l. cerasiforme, aunque menos empleada en mejora, resulta igualmente interesante por su mayor adaptación a desarrollarse en ambientes húmedos que el tomate cultivado. Esta adaptación le confiere la capacidad de tolerar hongos y bacterias, que se desarrollan en estas condiciones climáticas. Por otro lado, el amplio rango de distribución de S. pimpinellifolium, desde el norte de Ecuador al sur de Perú, colonizando desde ambientes con elevada humedad a zonas desérticas, le confiere una aptitud de tolerar estreses abióticos como la sequía. S.l cerasiforme, aunque mejor adaptada a ambientes húmedos también ha sido localizada en lugares con escasa pluviometría. Con el objeto de aprovechar el potencial de mejora de estas especies, el equipo solicitante desarrolló en un proyecto anterior (AGL2015- 71011-R) una población MAGIC a partir de ocho parentales, cuatro de ellos de S. pimpinellifolium y cuatro de S.l. cerasiforme. Los parentales fueron escogidos por su diversidad genética y su adaptación a condiciones ambientales muy diversas, desde zonas desérticas a ambientes con elevada humedad. En el proyecto anterior se secuenciaron los 8 parentales y se caracterizaron por resistencia a patógenos, salinidad y sequía. Se encontraron distintos niveles de resistencia/tolerancia a Fusarium oxysporum, Verticillium dahliae y Pseudomonas syringae. Así mismo, se encontró tolerancia a sequía y salinidad, principalmente en las entradas de S. pimpinellifolium y en una entrada de S.l. cerasiforme procedente del desierto de Sinaloa. Con estos antecedentes, solicitamos el presente proyecto, cuyos objetivos son los siguientes: 1) Genotipado de los ochos parentales y de la población MAGIC S5, 2) Cribado de la población MAGIC por resistencia a patógenos para los cuales se encontró resistencia en los parentales y para otros nuevos, incluyendo el recientemente detectado Tomato Brown Rugose Fruit Virus (ToBRFV), 3) Cribado de la población MAGIC por su tolerancia al déficit hídrico, 4) Análisis de datos: detección de QTLs y análisis de asociación GWAS y 5) Análisis RT-qPCR de los genes candidatos.