Resumen
El enfoque de BIODYNAMICS tendrá como objetivo demostrar que las factorías celulares microbianas multipropósito basadas en biología
sintética estandarizada y modular plug-and-play son una posibilidad real para una bioproducción más rápida, barata y efectiva. Para ello,
desarrollará nuevos métodos y herramientas de modelado y caracterización híbridos (basados en datos y mecanicistas) para ingeniería
metabólica sintética avanzada. En particular, se considerará el diseño, implementación y análisis de mecanismos óptimos de regulación
dinámica sintética en rutas metabólicas de novo para la producción de metabolitos de interés en factorías celulares microbianas. Se
centrará en métodos sensibles al contexto, que consideren modelos de asignación de recursos celulares y su interacción con el
crecimiento celular y los cambios ambientales que ocurren en el contexto de un biorreactor donde incluso puede coexistir una comunidad
de microorganismos simbióticos. También considerará el uso de biosensores metabólicos extendidos que brinden capacidades de
detección más allá de los efectores naturales. Para superar algunas limitaciones actuales a la hora de implementar dispositivos genéticos
sintéticos, BIODYNAMICS desarrollará herramientas de optimización y aprendizaje automático para la selección y caracterización
estándar componentes genéticos. Estos se integrarán dentro de un flujo de trabajo DBTL utilizando hardware y software de código abierto
de bajo coste, lo que facilitará la biosíntesis modular, automatizada y guiada por modelos. BIODYNAMICS validará sus métodos y
herramientas sobre la producción de fenilpropanoides de interés industrial utilizando el huésped bacteriano E. coli.
