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Bioinformática aplicada al estudio del genoma de especies hortícolas

Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana

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El crecimiento exponencial de la cantidad de información en las ciencias biológicas, especialmente en genómica y transcriptómica, plantea el desafío de analizar eficientemente grandes conjuntos de datos. Este aumento en la cantidad de datos supera la capacidad de los métodos y herramientas tradicionales, lo que dificulta el análisis y la extracción de información útil de estos datos masivos.

Las soluciones tradicionales suelen implicar el uso de herramientas de análisis genómico y transcriptómico disponibles en el mercado, así como el desarrollo de software específico por parte de equipos de investigación internos. Sin embargo, estas soluciones pueden no ser escalables ni eficientes para manejar grandes volúmenes de datos o pueden carecer de funcionalidades específicas necesarias para abordar ciertas preguntas biológicas.

La solución propuesta por el COMAV implica el desarrollo de nuevo software y la creación de servicios bioinformáticos que permitan analizar eficientemente grandes conjuntos de datos genómicos y transcriptómicos. Esto incluye sistemas automáticos de análisis de secuencias y la creación de interfaces web de fácil uso para acceder a los resultados de estos análisis.
Responsable científico

Blanca Postigo José Miguel

Aplicaciones

  • Desarrollo de software de análisis genómico y trasncriptómico.
  • Creación y mantenimiento de servidores bioinformáticos.

Ventajas técnicas

  • Posibilidad de uso de grandes cantidades de secuencia.
  • Análisis de los resultados de los nuevos sistemas de secuenciación.
  • Análisis genómicos y transcriptómicos completos.

Beneficios que aporta

  • Capacidad de realizar análisis complejos de forma sencilla.

Experiencia relevante

  • El servicio de bioninformática del COMAV cuenta con experiencia en el desarrollo de software para el análisis genómico y en la utilización de software de terceros para la realización de dichos análisis. Hemos realizado el análisis del proyecto español de genómica del melón. Asimismo, participamos en la iniciativa internacional de genómica del melón (www.icugi.org) y en el proyecto de secuenciación del melón.

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