HIPS : Software para la segmentación del hipocampo basado en dos protocolos de delineación diferentes utilizando imágenes de RM monomodales (T1w) y multimodales (T1w y T2w).

HIPS es una herramienta de segmentación basada en un método multiatlas basado en parches, capaz de segmentar automáticamente imágenes del hipocampo a partir de IRM T1w y/o T2w. HIPS está integrado en el servicio web volBrain. En primer lugar, el usuario proporciona al sistema una IRM 3D T1w y/o T2w. En primer lugar, el sistema preprocesa la imagen (eliminación de ruido, corrección de la falta de homogeneidad, registro) y, a continuación, segmenta los subcampos del hipocampo. HIPS dispone de dos protocolos de delineación diferentes, Winterburn (5 subcampos) o Kulaga-Yoskovitz (3 subcampos). Las etiquetas del protocolo Winterburn son: CA1, CA2/3, CA4/DG, SR/SL/SM y Subículo. Las etiquetas del protocolo Kulaga-Yoskovitz son: CA1-3, CA4/DG y Subículo. Una vez finalizado el proceso, se le notificará por correo electrónico para que pueda descargar un paquete que incluye algunos archivos de imagen y dos informes (CSV y PDF) que ofrecen todos los volúmenes estimados a partir de las segmentaciones. El PDF incluye la información del paciente, las clases de lesión, los volúmenes y su localización en el espacio MNI. También incluye varias instantáneas de los diferentes pasos de etiquetado como control de calidad.

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